萧昭业死时二十一岁，在位仅一年。事后，萧鸾以皇太后令来追认政变的合法性，加之萧昭业是个不折不扣的昏君，所以萧鸾等人的弑君行为被完美掩过。这是隆昌元年（494）的事情。
二
萧鸾推翻萧昭业后，完全可以自己当皇帝，但他没有这么做。他立文惠太子萧长懋的次子，也就是萧昭业的弟弟新安王萧昭文为帝。萧昭文被萧鸾扶上皇位时只有十四岁，无论大事小事都不能做主，完全仰仗萧鸾。他封萧鸾为宣城王，起居饮食都要征求萧鸾的同意。萧鸾对萧昭文控制得也很严。一次，萧昭文想吃蒸鱼，掌管宫廷膳食的太官令竟然回答没有萧鸾的命令不能给。
萧鸾为什么不自己当皇帝呢？他做什么事情都求稳，没有绝对的胜算不出手。尽管把皇帝紧紧地捏在手里，萧鸾依然对自身实力不自信。齐高帝、齐武帝子孙众多，而萧鸾近亲稀疏，且在位为官的很少。所以，萧鸾一方面大力扶持近亲，一方面开始迫害齐高帝、齐武帝的子孙——萧道成临终前最担心的骨肉相残的悲剧再次上演。
被萧鸾以萧昭文的名义诛杀的宗室亲王有：南兖州刺史安陆王萧子敬、南平王萧锐、晋熙王萧、南豫州刺史宜都王萧铿、桂阳王萧铄、衡阳王萧钧、江夏王萧锋、建安王萧子真、巴陵王萧子伦等。南齐曾在宗室诸王身边设置典签的官职，本意是监督诸王，防止他们谋反或者祸害百姓。如今，典签官被赋予实权，可以禁锢诸王，充当了萧鸾诛杀宗室的工具。